H1N1-mutasjon kan ha betydning for vaksinens effektivitet

WHO's referanselaboratorium i Storbritannia har observert at en av de fire sekvensene fra Ukraina med D222G/D225G-mutasjon ikke reagerer som ønskelig på pandemivaksinen. Informasjon fra den lukkede databasen GISAID som viser en sekvens merket "low reactor" av WHO's referanselaboratorium ble publisert av bloggeren Henry Niman i går, og New York Times har plukket opp saken i dag. "Originating Laboratory provider of clinical specimen(s) and/or virus isolate(s) [Ukraine, Kiev] Ministry of Health of Ukraine Address: Central Sanitary Epidemiological Station 41 Yaroslavskaya str. 04071 Kiev Ukraine Sample ID given by the sample provider Submitting Laboratory generator of data [UK, London] WHO Collaborating Centre Address: The National Institute for Medical Research (NIMR) The Ridgeway - Mill Hill London NW7 1AA, UK Sample ID given by the sequencing lab: Antigenic characterisation: A/California/7/2009 like. Low reactor" Henry Nimans kommentar: "However, this low reactor status is in marked contrast to earlier studies on vaccine target clones, which indicated D225G produce no difference in titer, highlighting the vagaries of reference anti-sera data." D225G Evades Immune Response New York Times skriver: "Dr. Fukuda also said W.H.O. scientists were “not sure” of the level of threat posed by a separate mutation that helps the virus reach the lungs. It has been found in Norway, Ukraine, Brazil, China, Japan, Mexico and the United States, in both serious and mild cases. Experts still need to see whether the mutation — whose shorthand name in virology is D222G or D225G — is becoming more common, and how often it leads to severe disease, he said. One isolate from Ukraine with the mutation had changed so that swine flu vaccine probably would not protect against it well, Britain’s national medical laboratory reported Friday. Flus mutate so fast, Dr. Fukuda cautioned, that announcing each change is “like reporting changes in the weather.”" Experts Say Swine Flu Mutations Do Not Warrant New Alarm WHO og nasjonale helsemyndigheter slik som Folkehelseinstituttet er ofte lite åpne om arbeidet sitt og det forekommer at sekvenser blir hemmeligholdt. Folkehelseinstituttet holder for øyeblikket tilbake minst to av sekvensene fra Norge med D222G/D225G. Folkehelseinstituttet forsikrer om at den nye mutasjonen som er observert i bla Ukraina og Norge ikke har betydning for pandemivaksinen som nå distribueres, men siden mange prøveresultater hemmeligholdes er det vanskelig å si hvor korrekt en slik vurdering er. Influensavirus er i stadig forandring og dette er grunnen til at vaksinen mot sesoninfluensa er forskjellig hvert eneste år. At en sekvens med D222G/D225G ikke reagerer på vaksinen kan bety at denne mutasjonen er av en slik art at den vil få betydning for vaksinens effektivitet i den nærmeste fremtid. D222G/D225G mutasjonen var kjent allerede da pandemivaksinen ble laget, men ble ikke valgt som utgangspunkt for vaksinen da den var lite utbredt og tester som ble utført dengang ikke indikerte at mutasjonen ville ha betydning for vaksinens effektivitet. I det siste er D222G/D225G observert i fire dødsfall i Ukraina, to dødsfall og en alvorlig syk i Norge, og to dødsfall i Frankrike. WHO og i Norge Folkehelseinstituttet har til nå hevdet det økende antall observasjoner av D222G/D225G trolig skyldes en rekke enkeltmutasjoner. Hverken WHO eller Folkehelseinstituttet kan imidlertid vise til noen studier som demonstrerer at virus med denne mutasjonen ikke kan smitte på vanlig måte, så det kan tenkes at antakelsen er feil og at virus med denne mutasjonen er i sirkulasjon og øker i utbredelse. Kilder: GISAID, Recombinomics, New York Times ----- Norske helsemyndigheter informerer slik på pandemi.no: "Det er ingen indikasjoner på at denne endringen i viruset betyr noe for effekten av vaksinen eller effekt av antivirale legemidler slik som Tamiflu. Dette støtter seg på resistensundersøkelser gjort på Folkehelseinstituttet samt på foreløpige antigene analyser gjort ved WHOs referanselaboratorium i London." Funn av mutasjon i H1N1-virus hos noen personer med alvorlig sykdom Informasjon fra GISAID: "Isolate ID: EPI_ISL_62012 Isolate name: A/Lviv/N6/2009 Passage details/history: throat swab Type: A / H1N1 Lineage: swl Collection date Date: 2009-10-27 Location: Europe / Ukraine Host: Human Additional host information Host properties: N/A Patient age: 26 Y Gender: M Zip code: Patient status: Deceased Last vaccinated: 0 Outbreak: Treatment: no treatment In-vivo pathogenicity test: Specimen source: Oropharyngeal Domestic status: Health status: Vaccinated: Specimen source: Strain or commercial product name used for vaccination: In-vivo pathogenicity test: Supplementary data Originating Laboratory provider of clinical specimen(s) and/or virus isolate(s) [Ukraine, Kiev] Ministry of Health of Ukraine Address: Central Sanitary Epidemiological Station 41 Yaroslavskaya str. 04071 Kiev Ukraine Sample ID given by the sample provider Submitting Laboratory generator of data [UK, London] WHO Collaborating Centre Address: The National Institute for Medical Research (NIMR) The Ridgeway - Mill Hill London NW7 1AA, UK Sample ID given by the sequencing lab: Antigenic characterisation: A/California/7/2009 like. Low reactor In vivo antiviral resistance: Adamantanes: Unknown Oseltarnivir: Unknown Peramivir: Unknown Zanamivir: Unknown Other: Unknown Note: Fatal case Additional Authors: Public domain Upload to DDBJ/EMBL/GB: no" Oppdatering 28/11/09 kl 21.00: "As has been noted daily in new media reports, D225G is widespread, and phylogenetic analysis shows that the sub-clade in Norway and Ukraine is even more widespread than reported isolate with D225G, raising concerns that the D225G is circulating undetected because most samples are collected from the upper respiratory tract, while D225G is largely in the low respiratory tract. The designation of a "low reactor" means that the titer of a reference anti-sera is reduced by at least 4 four. A four fold reduction in titer is typically called a mis-match and mismatched vaccines are a concern because a vaccination will not eliminate the new changes that reduced the titer, but will eliminate the wild type that competes with the variant. Therefore the use of a poorly match vaccine leads to increased vaccine resistance and in this case would select for D225G." WHO Silence on D225G Vaccine Mismatch Confuses Media Oppdatering 29/11/09 kl 20.00: "The above characterization of A/Lviv/N6/2009, which was placed on deposit at GISAID by Mill Hill, raises concerns about the evasion of pandemic H1N1 sequences which change position 225. The above isolate has only one amino acid change in HA, D225G, which strongly implicates D225G in the low reactor results. A low reactor reduces the titer by four fold or more, which signals a mismatch. Mismatched vaccine create the potential for the section of the variant, which could create problems since D225G was found in four of four fatal cases in Ukraine, and several countries (Brazil, Ukraine, Norway, France, China) found D225G in fatal and or severe cases." H1N1 RBD Changes at 225 Create Vaccine Mismatch Concerns Oppdatering 03/12/09 kl 14.00: Folkehelseinstituttet har nå publisert ytterligere en sekvens med D222G/D225G på GenBank. Sekvensen stammer trolig fra den danske lastebilsjåføren som døde i Norge. Folkehelseinstituttet hemmeligholder fortsatt en sekvens med D222G/D225G. I tillegg tilbakeholder Folkehelseinstituttet mange andre sekvenser. Prøver fra 70 pasienter er analysert, men bare sekvenser fra 26 pasienter er offentliggjort. Transmission of Novel D225G in Norway and Sweden Oppdatering 6/12/09 kl 03.00: Aftenposten skriver i kveld at ytterligere to tilfeller av mutasjonen er observert i Norge: "Dermed er det funnet totalt fem tilfeller av det som internasjonalt omtales som den norske mutasjonen." "Han påpeker at de to siste mutasjonene ikke er endelig bekreftet, men foreløpige tester tyder på at det er samme mutasjon." To nye med mutert virus